Индейцы племени Навахо возвращают к жизни специального агента Фокса Малдера, которому предстоит защитить жизнь агента Даны Скалли, а также их работу над расследованием фактов проведения испытаний на людях инфекций неизвестного происхождения и клонирования людей при помощи внеземных технологий, проводимого тайным синдикатом внутри правительства.
3x01: Благословенный путь / The Blessing Way 3x02: Скрепка / Paper Clip 3x03: Д.П.О. / D.P.O. 3x04: Последний покой Клайда Бракмана / Clyde Bruckman"s Final Repose 3x05: Список / The List 3x06: Слишком стеснительный / 2Shy 3x07: Прогулка / The Walk 3x08: Темница / Oubliette 3x09: Нисей / Nisei 3x10: 731 / 731 3x11: Откровения / Revelations 3x12: Война Копрофагов / War of the Coprophages 3x13: Парад планет / Syzygy 3x14: Гротеск / Grotesque 3x15: Пайпер Мару / Piper Maru 3x16: Апокриф / Apocrypha 3x17: Толкач / Pusher 3x18: Место, где живут духи / Teso Dos Bichos 3x19: Адские деньги / Hell Money 3x20: "Из внешнего космоса" Джоза Чанга / Jose Chung"s From Outer Space 3x21: Воплощение / Avatar 3x22: Трясина / Quagmire 3x23: Сыро смонтировано / Wetwired 3x24: Девочка, явись / Talitha Cumi
